خلاصه رساله دکتری
چکیده
تاکسونومی و تبارشناسی کنههای جنس (Acari: Ixodidae)Hyalomma ایران به روشهای مورفولوژیک و مولکولی
اسداله حسینی چگنی
کنه های جنس Hyalomma(Acari: Ixodidae) ناقل اصلی بیماریهای تیلریوز، آناپلاسموز، تب خونریزی دهنده کریمه کنگو و همچنین انگل خارجی پستانداران اهلی، عامل ایجاد کم خونی و تحریک میزبان هستند. با وجود اهمیت زیاد کنه های جنس Hyalomma در دامپزشکی و پزشکی اما هنوز وضعیت تاکسونومی و تبارشناسی گونه های این جنس در ایران به درستی روشن نشده است به همین دلیل مطالعه حاضر به منظور تعیین تنوع مورفولوژیک، شناسایی مولکولی و تعیین روابط تبارشناسی گونه های جنس Hyalomma براساس ژن های ITS2 و COI انجام شد. نمونه های کنه از نواحی مختلف ایران بر روی میزبانهای مختلف جمعآوری شدند. از نمونه های جمع آوری شده تعداد 960 نمونه کنه Hyalomma نر بالغ با استفاده کلیدهای تشخیص مورفولوژیک در سطح گونه مورد شناسایی قرار گرفتند و ویژگی های تاکسونومیک و تنوع آنها با استفاده از روشهای مورفومتریک و آماری بررسی گردید. از این تعداد، 105 نمونه کنه به وسیله روشهای مولکولی مورد بررسی قرار گرفتند. DNA نمونه های مورد نظر به روش فنل-کلروفرم استخراج شد و بخشی از نواحی COI و ITS2 هر نمونه تکثیر شد. برخی از آغازگرهای مورد استفاده در تکثیر بخشی از ناحیه ITS2 برای اولین بار طراحی شدند. در مطالعه حاضر سه آغازگر جدید برای تکثیر بخشی از ناحیه ITS2 کنه Hyalommaبا موفقیت توانستند قطعه مورد نظر را تکثیر کنند. تعداد 23 و 24 نمونه به ترتیب برای ژنهای COI و ITS2 توالییابی شدند. توالیها پس از ویرایش و بلاست در بانک ژن، با استفاده از نرمافزار MEGA6 هم تراز شده و میزان تنوع درون و بین گونه ای محاسبه گردید. برای ترسیم درخت تبارشناسی با روش neighbor-joining و parsimony از نرم افزار PAUP و برای ترسیم درخت تبارشناسی با روش Baysian از نرم افزار MrBayes استفاده شد. نتایج بررسی مورفولوژیک نشان داد که نُه گونه Hyalommaدر ایران وجود دارد و بر این اساس نیز یک کلید تشخیص برای نمونه های ایران تهیه شد. براساس نتایج مولکولی، اختلاف درون و بین گونهای در ژن COI به ترتیب بین صفر تا یک و هفت تا 19 درصد و اختلاف درون و بین گونه ای در ژن ITS2 به ترتیب بین صفر تا دو و شش تا 23 درصد برای گونه های Hyalomma محاسبه شد. نتایج بررسی تبارشناسی، وضعیت دو گونه نزدیک به هم H. asiaticumو H. anatolicum را از لحاظ گونه بودن تأیید میکند. اما با این وجود اعتبار گونه های H. rufipes و H. excavatum به چالش کشیده و پیشنهاد می شود این «گونه های مورفولوژیک» به سطح زیرگونه انتقال یافته و یا در زیر مجموعه به ترتیب گونه های H. marginatum و H. anatolicum قرار داده شوند.
واژه های کلیدی: تاکسونومی، درخت تبارشناسی، کنه Hyalomma، ایران، تنوع مورفولوژیک، COI، ITS2
Abstract
Taxonomy and phylogeny of Iranian ticks of the genus Hyalomma (Acari: Ixodidae) with morphologic and molecular methods
Asadollah Hosseini Chegeni
The ticks of the genus Hyalomma (Acari: Ixodidae) are the main vector of theileriosis, anaplasmosis, Crimean Congo haemorrhagic fever also external parasite of domestic mammals cause anemia, sensitivity and paralysis in their host. In spite of their importance in veterinary and medicine the taxonomic status and phylogeny of the Iranian species have not been cleared, properly. For this reason, the present study was conducted to determine morphological variation, molecular identification and to define phylogenetic relationships of the species of the genus Hyalomma based on COI and ITS2 genes. The tick specimens were collected on different hosts from different regions in Iran. The 960 male adult of Hyalomma tick from all collected specimens were identified morphologically to the level of species and their taxonomical characters and variations were studied with morphological methods. Out of this number, 105 tick specimens were selected for subsequent molecular methods. DNA of specimens was extracted by Phenol/Chloroform method and subsequently a part of COI and ITS2 gene region amplified for each. For amplification of a part of ITS2, three new primers were designed and tested. All newly designed primers could successfully amplify the target sequence. Twenty three and 24 amplified fragments for COI and ITS2 respectively were sequenced. All sequences were edited manually and after BLAST in GenBank, aligned using MEGA6 software and intra and inter species variation calculated. The phylogenetic tree was constructed with neighbor joining and parsimony methods using PAUP 4.0 software and Baysian inferences using MrBayes 3.0 software. The results of morphological studies showed that nine Hyalomma species occur in Iran. An identification key was compiled for the Iranian species. Based on molecular results, intra and inter species variation was calculated 0-1% and 7-19% for COI and 0-2% and 6-23% for ITS2, respectively. The phylogenetic results supported the identity of two closely related species H. asiaticum and H. anatolicum. Nevertheless, the validity of H. rufipes and H. excavatum species were challenged and suggested this “morphological species” transfer to subspecies level or in the subset of H. marginatum and H. anatolicum, respectively.
Keywords: Taxonomy, Phylogentic tree, Hyalomma tick, Iran, Morphological variation, COI, ITS2
وبلاگ حاضر با هدف آشنا کردن مخاطب با گروهی از بندپایان جالب، نوشته شده است و امیدوار است بتواند در به روز کردن آن موفق باشد. نویسنده وبلاگ به تحقیقات کنه شناسی علاقه مند و در صورت نیاز قادر به ارائه راهنمایی در این زمینه است.